Masterarbeit – Selektion von Peptidliganden für humane Atg8 homologe Proteine

Die Forschungsfelder des Institutsbereiches für Strukturbiochemie (IBI-7) umfassen die Untersuchung der 3D-Struktur, Dynamik und Interaktionen biomolekularer Komplexe, insbesondere in ihrer natürlichen zellulären Umgebung. Ein zentraler Schwerpunkt liegt auf der Erforschung der molekularen Grundlagen der synaptischen Funktion sowie der synaptischen Resilienz. Zur Aufklärung dieser Mechanismen kommt ein komplementäres Methodenspektrum aus Biochemie, Zellbiologie, biophysikalischen Analysen einschließlich modernster NMR-Techniken sowie molekularen Simulationen und KI-gestützten Ansätzen zum Einsatz.

Die Anpassungsfähigkeit synaptischer Strukturen unter Stress ist essenziell für die Funktion und das Überleben von Nervenzellen. Das Team „Synaptische Resilienz“ am IBI-7 erforscht die molekularen Mechanismen, die deren strukturelle und funktionelle Integrität aufrechterhalten. Ein besonders relevanter Prozess ist hierbei die Autophagie: Sie ermöglicht den kontrollierten Abbau von Zellbestandteilen und trägt maßgeblich zur Funktion von Synapsen bei. Die angebotene Masterarbeit ist Teil eines Projektes, welches die Eigenschaften eines zentralen Proteins der Autophagie und seine physiologisch relevanten Funktionen weiter charakterisiert.

Ihre Aufgaben im Team

• Expression und Reinigung von GABARAP, sowie Etablierung einer geeigneten Selektionsstrategie
• Durchführung von Phagendisplay Selektionen zur Identifizierung nicht-kanonischer GABARAP-Liganden
• NGS-basierte Datenauswertung zur Identifizierung und Priorisierung potentieller Peptidliganden
• Biochemische und/oder biophysikalische Charakterisierung von ausgewählten Peptiden
• Sorgfältige Planung der Experimente unter Einbezug der aktuellen Literatur
• Dokumentation der erzielten Ergebnisse in einem elektronischen Laborjournal
• Präsentation und Diskussion der Ergebnisse im Rahmen von regelmäßig stattfindenden Teammeetings

Das bringen Sie mit

• Aktuelles Masterstudium in Biologie, Biotechnologie oder einem verwandten naturwissenschaftlichen Studiengang
• Strukturierte, sorgfältige und zunehmend eigenständige Arbeitsweise sowie Zuverlässigkeit
• Erste praktische Erfahrungen im Labor; Erfahrungen in Proteinexpression und ‑reinigung sind von Vorteil
• Interesse an modernen Methoden und Freude daran, wissenschaftlichen Fragestellungen experimentell nachzugehen
• Teamfähigkeit und Freude an der Zusammenarbeit in einem interdisziplinären Team
• Sehr gute Deutsch- oder Englischkenntnisse

Freuen Sie sich auf folgende Benefits

• Praxisnähe: Bei uns sammeln Sie wertvolle Praxiserfahrungen neben dem Studium und wirken aktiv an einem aktuellen Forschungsprojekt mit. Dabei erhalten Sie praktische Einblicke in moderne molekularbiologische, proteinbiochemische und biophysikalische Methoden
• Wissenschaftliches Umfeld: Sie erwartet eine exzellente wissenschaftliche Ausstattung, moderne Technologien und eine qualifizierte Betreuung durch erfahrene Kolleg:innen. Sie arbeiten an einer aktuellen Forschungsfrage zur Identifizierung neuer GABARAP-Liganden und erhalten Einblicke in die Untersuchung autophagischer Prozesse
• Methodenvielfalt: Sie lernen verschiedene experimentelle Ansätze kennen – von der Proteinexpression und -reinigung über Phagendisplay-Selektionen bis hin zur NGS-basierten Datenauswertung und möglichen Charakterisierung ausgewählter Peptidliganden
• Eigenverantwortung: Sie gestalten Ihre Experimente zunehmend eigenständig und haben die Möglichkeit, eigene Ideen bei der Entwicklung und Optimierung der Selektionsstrategie einzubringen
• Campus-Erlebnis: Unser Forschungscampus im Grünen schafft ideale Bedingungen für kollegialen Austausch und sportlichen Ausgleich direkt vor Ort. In unserer Kantine erwartet Sie ein vielfältiges Angebot – Ihre Mittagspause können Sie entspannt mit Seeblick genießen

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr:

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.

Über die folgenden Links erhalten Sie weitere Informationen zu Vielfalt und Chancengerechtigkeit: sowie zur gezielten Förderung von Frauen:

Dienstort: Jülich

Beginn: Zum nächstmöglichen Termin

**Bewerbungsfrist:**Die Stelle wird bis zur erfolgreichen Besetzung ausgeschrieben

Kennziffer: 2026M-0783